En cada una de sus convocatorias, el programa Interreg Sudoe realiza un seminario para la gestión de los proyectos aprobados durante el cual los proyectos pueden obtener recomendaciones y pautas de la mano de la Secretaría conjunta y de las Autoridades del programa sobre distintos aspectos de la ejecución del proyecto como por ejemplo, la ejecución financiera y administrativa, la gestión del consorcio, la comunicación… Además, este evento marca el inicio oficial del proyecto al celebrarse la firma del acuerdo de concesión del fondo FEDER con la participación del jefe de fila y del representante de la Autoridad de gestión del programa.
La tercera convocatoria del programa se lanzó en septiembre del 2019 para los ejes 2, 3, y 4. De los 127 proyectos presentados, se aprobaron 18 en junio del 2019.