El objetivo de la CTP es contribuir al desarrollo de los Pirineos, teniendo en cuenta sus desafíos y apoyándose en sus fortalezas. La CTP busca favorecer los intercambios entre los territorios y las y los actores del macizo pirenaico, encontrar soluciones conjuntas a sus problemas comunes y poner en marcha acciones transfronterizas. Además, en 2010 la CTP creó el Observatorio Pirenaico de Cambio Climático (OPCC), para impulsar el conocimiento y la anticipación ante los impactos del cambio climático en el territorio pirenaico mediante acciones demostrativas y diferentes proyectos. Su misión es consolidarse como la plataforma de referencia en información climática y en acción a escala de macizo, ofreciendo herramientas que apoyen la toma de decisiones.